Description: Anàlisis bioinformàtiques
Search BIO DATA SCIENCE Bioinformàtica actualitzada Menú Més sobre l’autor Search Cerca: Close search Tanca el menú Més sobre l’autor Categories Bash Bioinformàtica Bulk RNA-seq Pipeline complet bulk RNA-seq. Part 1: fastq a count matrix Post author Per Tomàs Montserrat Ayuso Post date 10 d'Abril de 2023 Sense comentaris a Pipeline complet bulk RNA-seq. Part 1: fastq a count matrix Introducció
You can find the English version of this post following this link .
En les properes dues entrades estudiarem com dur a terme un pipeline complet de bulk-RNA-seq, des dels fitxers fastq fins a l’anàlisi estadístic. En aquesta primera entrada veurem tots els passos necessaris fins a obtenir la matriu de recompte a partir dels fitxers fastq de cada mostra. Vam veure com fer-ho, de forma simplificada per a una sola mostra, en aquesta entrada anterior . Ara, però, ens fixarem en un escenari més realista on no tenim només un fitxer fastq , sinó 98, comptant rèpliques tècniques i